Lidé při pěstování plodin často používají také chemické látky k odstraňování různých škůdců a plevelů, které se v umělých ekosystémech snadno přemnoží.

Tyto látky se označují slovem pesticidy. Jsou to látky jedovaté čili toxické; jsou to látky cizorodé, které se v potravních řetězcích nerozkládají, ale hromadí se v nich. V současné době se musí používání takových cizorodých látek na polích omezovat.